在农业应用中，草甘膦可用于防除各种杂草，如稗、狗尾草、看麦娘、牛筋草、马唐、猪殃殃等。用药量应根据杂草种类和生长阶段进行调整。例如，果园、桑园等地除草时，每亩用10%水剂0.5至1公斤可防除1年生杂草，而防除多年生杂草则需每亩用10%水剂1至1.5公斤。草甘膦对绿色组织有除草作用，因此用药量需根据杂草种类进行调整。在使用草甘膦后，至少需要间隔一周至十天才能种植大种子作物如玉米，若要种植小种子作物如蔬菜，最少需要一个月。残留期一般为一段时间，若用药量过大，甚至可能长达一年难以降解。在使用草甘膦时，应注意作物种类和生长阶段，以避免药害。例如，草甘膦不宜用于浅根系作物如葡萄、猕猴桃、桃树，否则可能导致叶片中毒和果实停止生长。对于串根长出小树苗的果树如枣树，草甘膦的使用也应谨慎。