1、价值观与传统理念冲突：小说中的一些观点，如“杀戮理所当然”和“生命卑如蝼蚁”，以及对主角性格的描绘（心狠手辣、不择手段），与传统的惩恶扬善理念相悖，这导致一些读者无法接受。2、内容新颖性：小说中的许多内容和故事传说与传统神话小说大相径庭，如对某些神话人物的重新解读和创作，这可能让习惯了传统神话故事的读者感到意外和不适。3、语言和文字风格：尽管《佛本是道》在某些方面受到了赞扬，如重新架构了中国传统神话体系，开创了“洪荒流”，并结合了佛道两家的神话故事，但也有批评指出作者的语言苍白和文字匮乏。4、商业化后的影响：作者梦入神机在商业化后，虽然收入增加，但在其他方面有所下降，这也可能影响了《佛本是道》的评价和影响力。