会的。公积金还款日如果没有扣款成功的话就算被算作逾期还款，所以一般建议在还款日之前就把钱存入卡中。当公积金还款日扣款失败时，系统会显示扣款失败，并且会发送短信提醒借款人。届时用户再去把钱存入卡中，公积金扣款系统会进行二次补扣款，甚至会有三次、四次，只要还款日当天扣款成功，那么则是正常还款。需要注意的是，如果公积金扣款失败后，发送短信提醒用户依旧没有及时存钱到卡中，从而导致逾期，那么这个逾期记录则无法修改。如果是因为在职单位没有及时缴纳公积金而导致公积金贷款还款失败，那么用户可以让单位出示相关证明，随后前往征信相关机构进行逾期记录更正操作。需要注意的是。如果公积金扣款失败后，发送短信提醒用户依旧没有及时存钱到卡中，从而导致逾期，那么这个逾期记录则无法修改。