存量留抵税额的计算公式是存量留抵税额=存量留抵税额×进项构成比例×60%。开始试点当月月初，企业应按不得从应税服务的销项税额中抵扣的增值税留抵税额，记应交税费，增值税留抵税额科目，记应交税费，应交增值税进项税额转出科目。待以后期间允许抵扣时，按允许抵扣的金额记应交税费，应交增值税科目，贷记应交税费，增值税留抵税额科目。二、分析；留抵退税就是对现在还不能抵扣、留着将来才能抵扣的进项增值税，予以提前全额退还。所谓的留抵税额，简单可理解为当进项税额大于销项税额时，即出现了留抵税额。进项税指的是纳税人在购进货物、无形资产或者不动产等时候支付的增值税额。而销项税，则指销售时收取的增值税额。形成留抵税额的原因有很多，比如集中投资、货物生产周期较长等。三、_留抵退税的办理流程是什么。