医疗机构内职工住房占用耕地的，应按规定缴纳耕地占用税。但需注意医疗机构占用耕地可享受免征耕地占用税的优惠。军事设施、学校、幼儿园、社会福利机构、医疗机构占用耕地，免征耕地占用税。免税的医疗机构，具体范围限于县级以上人民政府卫生健康行政部门批准设立的医疗机构内专门从事疾病诊断、治疗活动的场所及其配套设施。医疗机构内职工住房占用耕地的，按照当地适用税额缴纳耕地占用税。二、分析详情；耕地占用税是对占用耕地建房或从事其他非农业建设的单位和个人征收的税，属于国家税收的重要组成部分，特点体现在：兼具资源税与特定行为税的性质；在占用耕地环节一次性课征；采用地区差别税率；税收收入专用于耕地开发与改良。三、耕地占用税的算法。