1.普通PCR引物设计的主要目标是确保引物与模板DNA的序列互补，以便在PCR反应中可以有效地扩增出目的片段。因此，对于普通PCR引物来说，设计的关键在于选择与模板DNA的特定区域互补的序列，一般要求引物长度在15-30bp之间，上下游引物不能相差太大，且引物自身不能有连续4个碱基的互补，引物之间不能有连续4个碱基的互补等。2.基因突变引物设计则是为了在已知基因序列的基础上，对特定位置的碱基进行有目的的替换，通常是为了研究某个基因的关键功能域，甚至具体到某个氨基酸位点的作用。因此，突变引物设计的关键在于尽量突变较少的碱基数目以使氨基酸发生更改。例如，如果需要将编码Ala的密码子GCC突变为GCC（即不改变氨基酸），则需要改动1个碱基。