主要区别有，概念不同、工艺不同、用途不同、水质优缺点不同，具体如下：一、概念不同；1、蒸馏水；蒸馏水是指经过蒸馏、冷凝操作的水。2、自来水；自来水是指通过自来水处理厂净化、消毒后生产出来的水，主要通过水厂的取水泵站汲取江河湖泊及地下水，地表水。二、工艺不同；1、蒸馏水；蒸馏是一种热力学的分离工艺，它利用混合液体或液-固体系中各组分沸点不同，使低沸点组分蒸发，再冷凝以分离整个组分的单元操作过程，是蒸发和冷凝两种单元操作的联合。2、自来水；自来水是经过多道复杂的工艺流程，通过专业设备制造出来的饮用水。自来水的处理过程如下：