员工恶意击碎玻璃的行为是否违法需视具体情况而论。从法理角度讲，若碎裂的玻璃价值较大则可能触犯故意破坏财物罪行。依据《刑法》相关规定，故意损毁公共或私人财产且数额较大或情节严重者需负刑事责任。若玻璃价值较低，虽未构成犯罪，但仍属民事侵权行为。玻璃所有者有权向该员工索取民事赔偿以弥补其故意行为所致损失。另外，研究员工故意击碎玻璃的动机及场景亦为必要。如在工作环境下，该行为还可能违反公司规章制度，公司可依内部规定进行处置。