车管所一定要留下车辆合格证存档的。因为机动车合格证书落户后就装在机动车的档案里面了，在车管所存放。在办理落户的时候，必须交出机动车合格证书，没有合格证书的机动车是不能办理落户上牌手继续的。一、机动车落户流程如下：　1、购买机动车后，要先缴纳交强险，可以在4S店直接办理，也可以自己到保险公司办理。同时4S店要提供临时车牌。2、拿着交强险保单、购车发票、机动车出厂合格证书，到税务局缴纳车辆购置税。3、拿着购置税发票、购车发票、出厂合格证书、交强险保单、身份证，把车辆开到车管所，进大厅填写车辆落户申请表，缴纳落户费。然后到指定窗口查询是否免检车辆，是免检车辆的，直接打印免检合格证书。然后到室外进行拍照和外观检查，要准备好灭火器和警示三脚架，有免检合格证书的，不用上线检测。不是免检车辆的，还要上线检