单位犯罪与自然人共同犯罪的主要区别在于。1、产生犯意的时间不完全相同。单位犯罪中，犯意只能产生于犯罪行为实施以前。共同犯罪中，犯意产生的时间是较为随意的，既可以是在实施犯罪以前，也可以在实施犯罪过程中。2、犯意的种类不同。单位犯罪中的行为人在主观上表现为直接故意。共同犯罪的行为人在主观上既可以都表现为直接故意，也可以有的表现为直接故意，有的表现为间接故意，还可以都表现为间接故意。3、承载犯意的最终主体不同。单位犯罪中，犯罪活动是以单位的名义实施的，个人意志要通过单位的意志表现出来。共同犯罪中，除了各个共同犯罪人的犯意外，不存在其他犯意，犯罪活动一般就是以犯罪分子的名义实施的。这是区分单位犯罪和共同犯罪的一个重要标准。