方法一：一般治疗。帮助患儿的家长认识、理解病情，指导其改善患儿生活方式，调整饮食结构和习惯，去除与症状相关的可能发病因素，提高缓解症状的能力，非药物治疗包括认知治疗、调节饮食及改变排便习惯等，失眠、焦虑、抑郁等精神因素是儿童FD的一个重要病因，而儿童对反复的腹痛、腹胀等上腹部不适症状的耐受性差，这些症状可能反过来促发和加重患儿的精神症状，近几年，小儿身上在出现了消化不良的症状后，认知行为疗法，在对该病的治疗上最常被人们采用。方法二：药物治疗。根据患儿的临床表现及其与进餐的关系，可选用促动力药、抗酸药和抑酸药，一般疗程2～4周。具体选药原则详见儿童FD的诊治流程，治疗无效者可适当延长疗程，并可进一步检查，明确诊断后再进行治疗，有Hp感染者，需行Hp的根除治疗。