近亲结婚、夫妇双方任何一方患有遗传性疾病，都会影响胎儿智力的正常发育与发展，并会给家庭、社会带来无法挽救的危害。遗传性疾病可分为染色体异常、代谢异常和近亲结婚三大类。染色体异常，由于不良遗传因素的影响，或者某些偶然因素的作用，如准妈妈受到辐射，或受到风疹等病毒的感染，慢性缺氧，或先天性梅毒感染等，染色体会发生一些变异，因而形成遗传性疾病。此外，还有许多由于染色体异常导致的遗传性疾病，使患儿智力大多低下，比如以下疾病：猫叫综合征、克兰法勒综合征、杜氏综合征。代谢异常往往有家族史，一般认为其中大多数由基因突变所引起。由基因突变引起生物大分子结构的变化，所形成的酶或相关蛋白质异常，结果导致代谢出现了问题，诱发了疾病。