家族遗传疾病深度昏迷，重疾险公司拒赔是否应该遵循公平原则？

法律分析：重疾险公司拒绝赔付应依据合同条款，若涉及公平原则也需考虑保险公司的风险管理和利益保障。

法律依据：

1.《保险法》第十五条，保险合同双方应当遵循诚实信用原则，依法平等地履行合同义务，保险人应当承担保险义务。

2.《中华人民共和国合同法》第一百三十七条，当事人应当诚信履行合同义务，保险人应当按照合同的约定承担保险义务。

3.《中华人民共和国保险法实施条例》第二十条，重大疾病保险条款应当明确保险金给付的疾病种类、标准、限额等内容。

4.《最高人民法院关于审理保险合同纠纷案件适用法律若干问题的规定》第十二条，保险人对保险标的所发生的损失有赔偿责任，但是合同另有约定的除外。

综上所述，重疾险公司拒赔需考虑合同约定，同时也需遵循公平原则，但保险公司也有风险管理和利益保障的需要。