公司犯罪，员工应该如何证明自己的无辜？

法律分析：员工可以通过提供证据，如证人证言、录音录像、书面证明等，证明自己没有参与犯罪行为。但如果员工被控制在犯罪现场或与犯罪有关联，法律将对其进行相应的追责。

法律依据：

1.《刑法》第一百二十六条：有罪推定原则，犯罪嫌疑人或被告人如果无法提供清楚的证据证明自己的无罪，则有罪推定。

2.《刑事诉讼法》第三百五十九条：犯罪嫌疑人或被告人有权自行提供证据，也可以委托代理人提供证据，证据可以是物证、书证、证人证言、鉴定意见等。

3.《劳动合同法》第四十四条：用人单位应当保障职工的合法权益，不得降低、拒绝职工的工资报酬、社会保险等待遇。

在公司犯罪的情况下，员工应该主动维护自己的权益，提供证据证明自己无辜，同时可以要求公司给予相应的赔偿和保障。