协议离婚后独资企业怎么分割

离婚时独资企业分割的方式：若一方主张经营该企业的，应由其另一方进行补偿，双方均主张经营该企业的，可通过竞价处理所有权，再进行补偿，双方均不愿意经营该企业的，可通过拍卖等方式获得相应财产，由双方协议分割，协议不成的，由法院判决。
【法律依据】
《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第七十五条
夫妻以一方名义投资设立个人独资企业的，人民法院分割夫妻在该个人独资企业中的共同财产时，应当按照以下情形分别处理：
（一）一方主张经营该企业的，对企业资产进行评估后，由取得企业资产所有权一方给予另一方相应的补偿；
（二）双方均主张经营该企业的，在双方竞价基础上，由取得企业资产所有权的一方给予另一方相应的补偿；
（三）双方均不愿意经营该企业的，按照《中华人民共和国个人独资企业法》等有关规定办理。