案件审理中如果被告机关负责人不出庭怎么办

法律主观：

《 民事诉讼法 》第一百四十四条：被告经传票传唤， 无正当理由 拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。因此， 被告不到庭 并不影响法院判决。出庭辩论、质证、反诉是被告的重要诉讼权利， 被告不出庭 等于放弃了这些权利。发生法律效力的民事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。如果被告败诉，必须承担诉讼费用并履行生效判决，否则原告可以 申请强制执行 。

法律客观：

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百零九条人民法院对必须到庭的被告，经两次传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以拘传。第一百四十三条原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以按撤诉处理；被告反诉的，可以缺席判决。第一百四十四条被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。