正当经营卖小国旗不违法。但有以下情形的违法:将国旗及其图案用作商标和广告的。非法经营,扰乱市场秩序的。非法经营卖小国旗,情节严重的,处五年以下有期徒刑或者拘役,并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金;情节特别严重的,处五年以上有期徒刑,并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
《中华人民共和国国旗法》第十八条国旗及其图案不得用作商标和广告,不得用于私人丧事活动。