如何避免承包合同变更为合作合同后的纠纷？

法律分析：在承包合同变更为合作合同时，双方需注意原合同条款是否需要调整，并应就双方权利义务重新进行分配及明确。同时，变更后需签订书面协议并在法律上进行备案，以避免发生不必要的争议。

法律依据：

1.《中华人民共和国合同法》第十四条：订立合同，当事人应当遵循自愿、平等、诚信、公平的原则。

2.《中华人民共和国合同法》第四十四条：被订立的合同变更后，当事人应当重新确定权利、义务，达成一致意见，并按照约定的方式进行变更。

3.《中华人民共和国合同法》第八十九条：合同的修订或者补充，应当采取与订立合同同等的形式。合同书面形式的，修订或者补充协议也应当采取书面形式。

4.《中华人民共和国合同法》第九十条：当事人应当遵循诚实信用原则履行合同。任何一方不得以不履行或者延迟履行合同作为对抗对方主张权利的理由。

以上法律依据可帮助当事人充分了解承包合同变更为合作合同时的权利义务分配与备案等问题。同时，双方需注重诚信、公正等基本原则，以减少不必要的纠纷，保障各自合法权益的维护。