机关调取证据不配合怎么办

证人有义务配合机关调查取证的，但不配合的情况下，只能积极说服教育，使其配合机关调查取证，对待证人不能采取强制措施或进行传唤。在我国，除因生理上、精神上有缺陷或者年幼而不能辨别是非、不能正确表达意志的人以外，凡是知道案件情况的人，都有作证的义务。证人应如实地提供证言，如果作伪证或隐匿罪证，要负法律责任。是知道案件情况的单位和个人，都有义务出庭作证。有关单位的负责人应当支持证人作证。不能正确表达意思的人，不能作证。

一、没有直接证据，但间接证据同时符合下列条件的，可以认定被告人有罪：
1、证据已经查证属实；
2、证据之间相互印证，不存在无法排除的矛盾和无法解释的疑问；
3、全案证据已经形成完整的证明体系；
4、根据证据认定案件事实足以排除合理怀疑，结论具有唯一性；
5、运用证据进行的推理符合逻辑和经验。
二、轻伤证据不足该如何判决
1、机关可以调解结案。对原来认为“证据不足”的轻伤害案件经机关立案侦查终结后，应出具侦查终结报告书，送达双方当事人，并可对双方当事人进行说服教育，在双方当事人自愿的前提下，由双方当事人各自向机关写出调解申请书，在此基础上，机关可以组织调解结案。这样便于稳定双方情绪，及时化解矛盾；
2、由被害人提起自诉。对基本事实清楚、基本证据确实充分、且机关一时又不能说服双方当事人自愿调解的一般轻伤害案件，机关应当告知受害人向人民提起刑事附带民事诉讼。对机关侦查后认为伤害证据仍然不足，或难以查清，或机关不认为是犯罪的轻伤害案件，机关应当告知被害人向人民提起民事诉讼，要求对方承担民事责任；
3、对特殊案件实行“有限公诉”。即对符合上述一般公诉条件，案情复杂、社会影响或危害较大、机关已对被告人采取了强制措施、可以判处刑罚的轻伤害案件，机关应该将案件尽快移送检察机关依法提起公诉。

法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》 第七十条 人民有权向有关单位和个人调查取证，有关单位和个人不得拒绝。人民对有关单位和个人提出的证明文书，应当辨别真伪，审查确定其效力。