公司犯罪中，员工犯罪所得如何追究？

法律分析：

在公司犯罪中，员工犯罪所得的追究问题，需要分别考虑刑事责任和民事责任两个层面。

从刑事责任方面来看，员工的犯罪行为应该由司法机关追究刑事责任。根据我国刑法的规定，对于员工在工作岗位上犯罪所得的处理，应当按照刑法的相关规定进行处罚。例如，员工涉嫌受贿、贪污、侵犯商业秘密等罪名，应当由司法机关依法追究刑事责任。

从民事责任方面来看，公司应该追究员工的经济赔偿责任。根据《中华人民共和国合同法》和《中华人民共和国侵权责任法》的相关规定，员工在公司工作过程中犯罪所得所导致的经济损失应由员工承担经济赔偿责任。同时，公司也可以向司法机关提起民事诉讼，追究员工经济赔偿责任。

法律依据：

《中华人民共和国刑法》

第三百八十四条 员工有下列行为之一的，由依法追究刑事责任：

（一）侵犯单位财物或者接受贿赂财物；

（二）利用职权侵犯单位利益或者他人合法权益，或者在单位间隙利用职权从事经营活动；

（三）泄露、篡改或者毁坏单位秘密或者有关资料；

（四）违法占有、私分或者挪用国有、集体或者私人财物；

（五）其他侵害单位利益或者违反职责的行为。

《中华人民共和国合同法》

第九十五条 当事人可以约定违约金，但是违约金不得超过当事人因违约受到的实际损失，也不得超过与合同约定的债务履行内容价值的百分之二十。当事人对违约金未作约定或者约定不明确、不具体的，人民根据违约情况及其后果，酌情确定违约金。

《中华人民共和国侵权责任法》

第四条 因非法侵权行为造成他人损失的，侵权人应当承担侵权责任。

第二十九条 有关单位的员工、代理人、服务人员等因执行工作任务侵权造成他人损失的，除该单位能够证明已经尽到管理和监督职责外，由该单位承担侵权责任。