| 分类 | 保税港区（综合保税区） | 自贸试验区 | 自由贸易港区 |
| 是否享受 入区退税 | 是，区外企业将产品出口至区内即可退税 | ||
| 允许开展业务范围 | 存储进出口货物及其他未办结海关手续货物；国际转口贸易；国际采购、分销和配送；国际中转；检测及售后服务维修；商品展示；研发、加工、制造；港口作业 | ||
| 不得开展业务范围 | 不得开展商业零售业务，不得建立商业性生活消费设施，国家禁止进出口货物及物品不得进出区 | ||
| 加工贸易管理 | 不实行加工贸易银行保证金台帐和合同核销制度，不实行单耗标准管理 | 一次备案多次使用、工单式核销 | |
| 进出境货物 | 进出境货物实行备案制 | 先进区后报关、简化随附单证、统一备案清单、原产地无纸化、一次备案多次使用、国际海关AEO互认、仓储货物分类监管、境内外维修、智能化卡口验放 | |
| 港区与境外进出的货物，不实行进出口配额、许可证管理 | |||
| 进境免税货物：1、基础设施建设所需的设备、物资;2、企业开展业务需要的机器、设备、模具及其维修用零配件;3、自用合理数量的办公用品 | |||
| 进境照章纳税货物：自用交通工具、生活消费用品 | |||
| 进出区货物 | 港区与区外进出的货物，按进出口货物规定办理申报手续，按照货物进出区时的实际状态征税，出具配额、许可证件。可集中申报。 | 保税展示交易、融资租赁、批次进出集中申报、简化备案清单、智能化卡口验放、选择性征税、集中汇总纳税、期货保税交割、委内加工、境内外维修、中介结构辅助开展保税核查核销稽查工作、企业信用信息公开、企业协调员、国际海关AEO互认、一次备案多次使用、大宗商品现货市场保税交易、归类行政裁定全国适用 | 。 |
| 对区内货物 的监管 | 港区货物可自由流转，转让、转移时货物的具体品名、数量、金额等向海关电子数据备案 | 仓储货物分类监管、仓储企业联网监管、区内自行运输 | |
| 出境加工 | 出境加工（适用区外企业） |
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