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RNAi步骤

来源:动视网 责编:小OO 时间:2025-09-24 09:01:11
文档

RNAi步骤

大肠杆菌发酵生产dsRNA1、引物设计:利用已获得的二化螟APN3、APN4的序列,用Primer5.0软件设计dsRNA引物。2、dsRNA表达载体的构建:利用r-Taq酶,Tm值为60-50℃降落程序进行PCR,电泳,目标条带切胶回收,和绿色荧光蛋白基因片段EGFP一起连接至pGEM-Teasyvector载体。然后用性内切酶EcoR酶切获得粘性末端,再电泳回收。酶切反应体系如下:VectorFDBufferFDEcoRSteriledeionizedH2O5μg10μl5μlUpto
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导读大肠杆菌发酵生产dsRNA1、引物设计:利用已获得的二化螟APN3、APN4的序列,用Primer5.0软件设计dsRNA引物。2、dsRNA表达载体的构建:利用r-Taq酶,Tm值为60-50℃降落程序进行PCR,电泳,目标条带切胶回收,和绿色荧光蛋白基因片段EGFP一起连接至pGEM-Teasyvector载体。然后用性内切酶EcoR酶切获得粘性末端,再电泳回收。酶切反应体系如下:VectorFDBufferFDEcoRSteriledeionizedH2O5μg10μl5μlUpto
大肠杆菌发酵生产dsRNA

1、引物设计:利用已获得的二化螟APN3、APN4的序列,用Primer 5.0 软件设计dsRNA引物。

2、dsRNA表达载体的构建:利用r-Taq酶,Tm值为60-50℃降落程序进行PCR,电泳,目标条带切胶回收,和绿色荧光蛋白基因片段EGFP一起连接至pGEM-T easy vector载体。然后用性内切酶EcoR酶切获得粘性末端,再电泳回收。酶切反应体系如下:

Vector

FD Buffer

FD EcoR 

Sterile deionized H2O

5 μg

10 μl

5 μl

Up to 100 μl

总体积100 µl
将pET-2P-GFP表达载体快速酶切去磷酸化,再电泳回收。快速酶切去磷酸化反应体系如下:

PET-2P-GFP表达载体

10×FastDigest Buffer

FastDigest EcoR 

Fast AP

Sterile deionized H2O

1 μg

2 μl

1 μl

1 μl

Up to 20 μl

总体积20 µl
37℃,5min;80℃,5min。

将线性化的pET-2P载体和具有EcoR酶粘性末端目标基因片段连接,得到表达目标基因dsRNA的质粒,分别命名为:pET-2P-APN3、pET-2P-APN4。假设pET-2P载体和目的片段浓度相等,T4连接反应体系如下:

pET-2P载体

目的片段

10×T4 DNA ligase Buffer

T4 DNA ligase

Sterile deionized H2O

6 μl

3 μl

2 μl

1 μl

Up to 20 μl

总体积20 µl
4℃过夜连接。

将连接后的表达载体10 µl转入50 µl感受态DH5α,冰上放置30 min,42℃热击90 s,冰上放置2 min。在超净台中加无抗生素的LB液体培养基600 µl,200 r,1-1.5 h。吸出450 µl,留200 µl涂板(抗卡那霉素的固体培养基)。将平板盖朝上放入37 ℃恒温培养箱,0.5 h后将平板翻转放置,过夜后挑斑,摇菌菌液PCR。PCR后电泳有目的条带的菌液扩大培养后提取质粒。

3、载体表达dsRNA验证

将上述获得的所有质粒都使用标准方法转化到HT115(DE3)大肠杆菌感受态细胞中,单克隆在含有100 μg/ml的卡那霉素和12.5 μg/ml四环素的LB培养基中37℃,250 rpm震荡培养14 h。将细菌发酵液按照1:100的比例接种到LB液体培养基中,当OD600=1.0时,加入IPTG至终浓度为0.1 mM,在37℃条件下继续发酵3 小时。取菌液3 ml,提取其总核酸,进行1%琼脂糖凝胶电泳,检测载体是否表达dsRNA,即出现特异性条带。若结果为阳性,在10 µl总核酸提取液中加入1 µl稀释了200倍的RNase A,37 ℃温育5 min后,进一步电泳检测结果。

提取大肠杆菌的总核酸,步骤如下:

1.5 ml细菌发酵液10000 g离心5 min,弃上清,菌体用30 μl的STE buffer悬浮,再加入30 μl苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1,pH8.0),剧烈涡旋震荡100 s以上,在离心机中13000 g离心5 min,上清液即为大肠杆菌的总核酸。

4、喂食dsRNA试验方法

将已构建好的的pET-2P-APN3、pET-2P-APN4、pET-2P-GFP的大肠杆菌表达载体以1:1000的比例扩大培养在含有100 μg/ml的卡那霉素和12.5 μg/ml四环素的LB液体培养基中,于37 ℃,250 rpm条件下震荡培养至OD600=1.0,然后加入IPTG至终浓度为0.1mM,继续发酵3小时。将菌液倒入200ml离心瓶中,在7000 g下离心5min,去除上清液后,用10ml超纯水悬浮菌体沉淀。将菌液倒入200ml离心瓶中,在7000 g下离心5min,去除上清液后,加入10ml培养基悬浮菌体沉淀。在24孔板中打入400μl体积饲料,二化螟初孵2天后挑入24孔板中。每个孔打入100μl菌液,待干后将1~2头二龄二化螟幼虫挑入孔中,每40头一个重复,每处理组三个重复。每天重复以上操作以获得新鲜的dsRNA,每天将幼虫跳入新的24孔板中,连续喂食6天。饥饿16h后,每组取6-10头虫迅速液氮冷冻后放入-80℃用于定量PCR实验,剩余每个基因三组重复,每组30头虫进行毒力测定。Cry1Ac活化毒素的LC50为0.3μg/100μl,分别选取两个剂量的Cry1Ac毒素(0.5μg/100μl,0.8μg/100μl)进行RNAi后的毒力测定。

实验技术路线:

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大肠杆菌发酵生产dsRNA1、引物设计:利用已获得的二化螟APN3、APN4的序列,用Primer5.0软件设计dsRNA引物。2、dsRNA表达载体的构建:利用r-Taq酶,Tm值为60-50℃降落程序进行PCR,电泳,目标条带切胶回收,和绿色荧光蛋白基因片段EGFP一起连接至pGEM-Teasyvector载体。然后用性内切酶EcoR酶切获得粘性末端,再电泳回收。酶切反应体系如下:VectorFDBufferFDEcoRSteriledeionizedH2O5μg10μl5μlUpto
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