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基因参考序列一般的命名格式

来源:动视网 责编:小OO 时间:2025-09-27 00:14:09
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基因参考序列一般的命名格式

RefSeq一般的命名格式:前缀为两个字母,然后下横线('_')。区别于其它的GenBank的命名格式。AccessionMoleculeMethod@Note说明AC_123456GenomicMixedAlternatecompletegenomicmolecule.Thisprefixisusedforrecordsthatareprovidedtoreflectanalternateassemblyorannotation.Primarilyusedforviral,prokaryot
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导读RefSeq一般的命名格式:前缀为两个字母,然后下横线('_')。区别于其它的GenBank的命名格式。AccessionMoleculeMethod@Note说明AC_123456GenomicMixedAlternatecompletegenomicmolecule.Thisprefixisusedforrecordsthatareprovidedtoreflectanalternateassemblyorannotation.Primarilyusedforviral,prokaryot
RefSeq一般的命名格式:前缀为两个字母,然后下横线('_')。区别于其它的GenBank的命名格式。

AccessionMoleculeMethod @

Note说明 

AC_123456GenomicMixedAlternate complete genomic molecule. This prefix is used for records that are provided to reflect an alternate assembly or annotation. Primarily used for viral, prokaryotic records.基因组序列,主要是病毒、原核生物。
AP_123456ProteinMixedProtein products; alternate protein record. This prefix is used for records that are provided to reflect an alternate assembly or annotation. The AP_ prefix was originally designated for bacterial proteins but this usage was changed.蛋白序列,AP_原本只用于细菌的蛋白。

NC_123456GenomicMixedComplete genomic molecules including genomes, chromosomes, organelles, plasmids.全基因组序列,包括细胞器的、质粒等
NG_123456GenomicMixedIncomplete genomic region; supplied to support the NCBI genome annotation pipeline. Represents either non-transcribed pseudogenes, or larger regions representing a gene cluster that is difficult to annotate via automatic methods.不完整的基因组序列,
NM_123456

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mRNAMixedTranscript products; mature messenger RNA (mRNA) transcripts.成熟的mRNA

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NP_1234567

ProteinMixedProtein products; primarily full-length precursor products but may include some partial proteins and mature peptide products.全长蛋白序列。但也有可能包括非全长的蛋白或成熟的多肽序列。
NR_123456RNAMixedNon-coding transcripts including structural RNAs, transcribed pseudogenes, and others.不编码的RNA,假基因或其它

NT_123456GenomicAutomatedIntermediate genomic assemblies of BAC and/or Whole Genome Shotgun sequence data.BAC法或鸟法得到的基因组序列

NW_123456

NW_1234567

GenomicAutomatedIntermediate genomic assemblies of BAC or Whole Genome Shotgun sequence data.BAC法或鸟法得到的基因组序列

NZ_ABCD12345678GenomicAutomatedA collection of whole genome shotgun sequence data for a project. Accessions are not tracked between releases. The first four characters following the underscore (e.g. 'ABCD') identifies a genome project.'ABCD'代表的是具体的基因组计划

XM_123456

XM_1234567

mRNAAutomatedTranscript products; model mRNA provided by a genome annotation process; sequence corresponds to the genomic contig.转录序列
XP_123456

XP_1234567

ProteinAutomatedProtein products; model proteins provided by a genome annotation process; sequence corresponds to the genomic contig.蛋白序列
XR_123456RNAAutomatedTranscript products; model non-coding transcripts provided by a genome annotation process; sequence corresponds to the genomic contig.不编码的转录序列,
YP_123456

YP_1234567

ProteinMixedProtein products; no corresponding transcript record provided. Primarily used for bacterial, viral, and mitochondrial records.蛋白序列,没有对应的转录序列。用于细菌、病毒和线粒体
ZP_12345678ProteinAutomatedProtein products; annotated on NZ_ accessions (often via computational methods).蛋白序列。来自对应的NZ_开头的核酸序列。

NS_123456GenomicAutomatedGenomic records that represent an assembly which does not reflect the structure of a real biological molecule. The assembly may represent an unordered assembly of unplaced scaffolds, or it may represent an assembly of DNA sequences generated from a biological sample that may not represent a single organism.比较复杂

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基因参考序列一般的命名格式

RefSeq一般的命名格式:前缀为两个字母,然后下横线('_')。区别于其它的GenBank的命名格式。AccessionMoleculeMethod@Note说明AC_123456GenomicMixedAlternatecompletegenomicmolecule.Thisprefixisusedforrecordsthatareprovidedtoreflectanalternateassemblyorannotation.Primarilyusedforviral,prokaryot
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