往来港澳通行证的有效期分为两种：5年和10年。5年通行证适用于未满16周岁的申请人，10年通行证则适用于16周岁及以上的申请人。
对于往来港澳签注的类型，主要有探亲签注、商务签注、团队旅游签注、个人旅游签注以及逗留签注。探望兄弟姐妹、（外）祖父母、（外）孙子女等亲属，可签发3个月一次签注，逗留不超过14天。探望配偶、父母或配偶的父母等，可签发3个月多次签注，逗留不超过90天，60周岁及以上人员可签发1年多次签注。赴港澳探望配偶且有未成年子女的，可以签发1年多次签注。特殊家庭困难的，经省级公安机关出入境管理部门核准，可签发1年多次签注。商务签注分为已备案企业和未备案企业，已备案企业可签发3个月一次签注、3个月多次签注、1年多次签注，每次逗留不超过7天。未备案企业、个体工商户经营者及驾驶往返广东与港澳专门交通工具人员，签发3个月一次签注或1年多次签注，每次逗留不超过7天。
团队旅游签注分为赴香港和澳门，香港签注可以签发3个月一次、3个月二次、1年一次、1年二次签注，每次逗留不超过7天。澳门签注可以签发3个月一次、1年一次签注，每次逗留不超过7天。个人旅游签注同样分为赴香港和澳门，香港签注可以签发3个月一次、3个月二次、1年一次、1年二次签注，每次逗留不超过7天。澳门签注可以签发3个月一次、1年一次签注，每次逗留不超过7天。
逗留签注适用于赴香港或澳门随任、就学、就业、居留、培训或作为受养人赴香港依亲的人员。赴香港签注有效期根据香港入境事务处签发的进入许可最长有效期签发，持证人需按香港进入许可规定入出香港。赴澳门签注有效期根据中央人民政府驻澳门特别行政区联络办公室、澳门高等教育辅助办公室、治安警察局出入境事务厅或劳工事务局、社会文化司批准的期限签发。
其他签注可根据具体情况签发3个月一次、3个月二次签注，特殊情况可签发3个月多次签注，每次逗留不超过14天。
