公司擅自扣除薪资往往背离常规，然而需斟酌个案实际状况。
依据现行中华人民共和国劳动法相关条例，雇主须严格依照劳动合同时所定及国家有关规定，准时全额地支付劳动者薪酬。
若公司未经适当解释而扣薪，如缺乏明确的规章制度支持，或未经与员工充分协商等，皆可视为违法规令。
然而，在特殊情况下，如劳动者对公司造成经济损失，公司依法从其工资中扣除相应赔偿部分，且扣除后的工资仍不得低于当地最低工资标准，此种扣薪行为或许合法。
若您认为公司扣薪违法，请妥善保存工资单、劳动合同等相关证据，通过劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以保护个人权益。
