1. 深井 青，Ao Fukai，13岁，居住在冲绳磐户岛的少年，为前作优莱卡和兰顿·萨斯顿的儿子，性格横冲直撞，现加入Generation Blue。
2. 优莱卡エウレカ，Eureka，前作女主角，曾坠落冲绳，与珊瑚岩并存，后来消失在战斗中，13年后以少女模样出现，证实为来自未来的人。
3. 兰顿·萨斯顿レントン，Renton，前作男主角，成为出色机师，创造尼尔瓦修（Mark 1），为了找回优莱卡而穿越时空。
4. 诺亚ノア，Noah，西中举表岛三趾树懒，与青是好朋友，跟随苍进入Generation Blue。
5. 阿拉塔·娜露Arata Naru，深井青的青梅竹马，灵媒力量觉醒，身体被珊瑚岩粒子侵蚀，与青驾驶尼尔瓦修战斗。
6. 弗勒尔·白フレア ブラン，Fleur Blanc，Generation Blue的代理社长，视青为竞争对手，关心青。
7. 埃琳娜·皮普鲁斯エレナ ピ－プルズ，Elena Peoples，IFO驾驶员，超喜欢“二次元”，背叛Generation Blue后回归。
8. 克里斯多福·布兰クリストフ プラン，Christophe Blanc，Generation Blue的社长，启动珊瑚岩融合爆炸，将社长职位交给女儿。
9. 蕾贝卡·哈鲁斯特雷姆レベッカ ハルストレム，Rebecka Hallstrom，斑衣笛手作战参谋，实际为Big Blue World的观察员。
10. 史坦利スタンリー，Stanley，Generation Blue的副社长，后来转投美军。
11. 米勒ミラー，Miller，Generation Blue的专属歌手，实为美国和英国派来的间谍。
12. 伊维卡·塔诺维奇イビチャ タノヴィッチ，Ivica Tanovic，斑衣笛手队长，退休军人，知道青母亲背景。
13. 布鲁诺·汉斯ブルーノ ハンス，Bruno Hans，金发女孩小队队长，对成员如父亲，在战役中牺牲。
14. 克洛艾麦卡佛瑞クロエマキャフリイ，Chloe McCaffrey，金发女孩小队IFO少女驾驶员，父母双亡，感受到布鲁诺的父爱。
15. 美芙麦卡佛瑞メイヴマキャフリイ，Maeve McCaffrey，金发女孩小队IFO少女驾驶员，父母双亡，与妹妹经营面包店。
16. 关玛姬マギークァン，Maggie Kwan，金发女孩小队IFO少女驾驶员，中国人，与妹妹康复归队。
17. 汉娜．贝斯特ハンナベスター，Hannah Bester，战舰Poseidon舰长，被卫星相撞和炮弹射击战舰Poseidon。
18. 刘瑛リュウイン，Liu Ing，IFO少女驾驶员，曾工作于战舰Poseidon。
19. 丽乐朵．福德レラトフード，Lerato Food，IFO少女驾驶员，曾工作于战舰Poseidon。
20. 拉吉库玛．奈尔ラジクマールナーイル，Rajkumar Nair，IFO少年驾驶员，曾工作于战舰Poseidon。
21. 盖欧格ゲオルグ，Georg，Generation Blue的人工智能系统，具有资料库帮助解决问题。
22. 亚历山大．波伊尔アレクサンダーボイル，Alexander Boyle，IFO保养技师，对各部件了如指掌。
23. 葛吉尔ガゼル，Gazelle，运送屋队长，葛吉尔商社社长，与皮珀和韩同伙，后加入Generation Blue。
24. 皮珀ピッポ，Pippo，葛吉尔的同伴，正义感强烈，但胆子小。
25. 韩 橘诺ハン ジュノ，Han Juno，葛吉尔的同伴，四国混血儿，擅长电脑相关。
26. 深井 敏夫フカイ トシオ，Fukai Toshio，磐户岛诊所老医师，真心疼爱青。
27. 图鲁ストゥルース，Truth，谜一般的人物，曾与尼尔瓦修（零式）战斗，寄生在原型机体中。
28. 祖安逊ヨハンソン，Johnhanson，思想家，收养图鲁斯，灌输对抗珊瑚岩的想法。
29. 中村ナカムラ，Nakamura，日本自卫省特务情报队情报官，对珊瑚岩和Secrets作战的实验，后与图鲁斯合作。
30. 远藤エンドウ，Endou，军人，曾与优莱卡相遇，为保护她而牺牲。
