劳动合同丢失，可通过以下证据证明用人单位与劳动者存在劳动关系，继续申请仲裁：劳动者填写的用人单位招用记录；工资支付凭证或记录、缴纳各项社会保险费的记录；考勤记录；用人单位向劳动者发放的能够证明身份的证件；其他劳动者的证言等。
一、如果未签劳动合同要如何证明劳动关系
如果未签劳动合同，劳动者可以通过以下证据证明存在劳动关系，比如工资支付凭证（银行转账凭证）或记录（工资发放的名册）、缴纳各项社会保险费的凭证；用人单位向劳动者发放的工作证、服务证等能够证明身份的证件；劳动者填写的登记表、报名表等招用记录；考勤记录以及其他同事的证言等。
二、住院费单据能证明劳动关系吗
住院费单据不能证明劳动关系。用人单位与劳动者存在劳动关系的凭证：劳动合同；考勤记录；劳动者填写的用人单位招用记录；工资支付凭证或记录、缴纳各项社会保险费的记录；用人单位向劳动者发放的能够证明身份的证件；其他劳动者的证言等。
三、没有签订劳动合同怎么证明劳动关系
用人单位与劳动者没有签订劳动合同，可以通过以下凭证证明双方存在事实劳动关系：劳动者填写的用人单位招用记录；用人单位向劳动者发放的能够证明身份的证件；工资支付凭证或记录、缴纳各项社会保险费的记录；考勤记录；其他劳动者的证言等。
【本文关联的相关法律依据】
《劳动和社会保障部关于确立劳动关系有关事项的通知》第二条
用人单位未与劳动者签订劳动合同，认定双方存在劳动关系时可参照下列凭证：
（一）工资支付凭证或记录（职工工资发放花名册）、缴纳各项社会保险费的记录；
（二）用人单位向劳动者发放的“工作证”、“服务证”等能够证明身份的证件；
（三）劳动者填写的用人单位招工招聘“登记表”“报名表”等招用记录；
（四）考勤记录；
（五）其他劳动者的证言等。
其中，（一）、（三）、（四）项的有关凭证由用人单位负举证责任。
