购房合同中的开发商设定违约金万分之一是否合法需依据多种因素进行评估。
从法律角度而言，只要双方签订合同时自愿同意，且无任何欺诈、胁迫等行为导致合同无效或可撤销，则此约定即可视为合法。
然而，若设置的违约金明显偏低，无法弥补购房者因开发商违约所受之损失，购房者有权要求或仲裁机构适度提高。
例如，若实际损失远超按万分之一计算的违约金，便有可能根据实际损失、合同履行状况以及当事人责任大小等因素，对违约金金额进行调整。
因此，万分之一的违约金设定本身或许合法，但其合理性和公正性仍需结合具体情况进行分析。
