1. 交通基础设施发展滞后，不能满足经济需求。我国交通基础设施发展不足，尤其是与欧美国家及部分发展中国家相比，存在明显差距。这导致主要运输通道客货运输能力不足，对国民经济发展产生负面影响。
2. 交通运输业发展无法满足居民生活需求。随着经济发展，居民消费模式转变，对运输服务的需求不断提高。目前，我国交通运输服务在快捷、舒适、安全等方面仍有待提升。城市公共交通系统不发达，给居民出行带来不便。
3. 交通运输设施区域布局不合理，影响协调发展。东部地区交通发达，而中西部地区特别是西部地区交通落后，严重制约当地经济社会发展。为实现国家长期安全与社会稳定，有必要改善中西部地区交通基础设施。
4. 能耗高、污染严重，不符合可持续发展要求。交通运输业发展导致资源破坏和环境污染，对未来资源和环境造成严重影响。为此，需提高交通运输业能源利用效率，减少污染排放。
5. 技术装备水平低，影响运输效率提升。我国交通运输技术装备水平与发达国家相比有较大差距，导致运输效率不高，能源浪费严重，环境污染加剧。
6. 运输方式分工不合理，市场竞争不规范。我国各种运输方式在分工上存在不合理之处，市场竞争不规范，影响各种运输方式优势发挥。未来应优化运输方式分工，规范市场竞争，实现协调发展。
7. 承担过多社会责任，不利于行业发展。交通运输业在实现商品和人员跨地域流动的同时，还需承担诸多社会责任，如支援国家重点经济建设、防灾减灾等。这使得企业无法专注于经营活动，影响行业发展。
8. 政企不分，阻碍行业发展。交通运输领域存在政企不分的问题，导致企业无法成为独立的市场主体，面临诸多体制性障碍。未来应推进政企分开，让企业独立面对市场，促进交通运输业健康发展。
