
在学习和应用Real-time PCR技术时,我们常常会遇到如何准确分析实验结果的问题。当得到的内参和目的基因的Ct值在15-25之间,熔融曲线也是单峰时,这通常表明实验条件较为理想,但如何解读这些数据却需要一定的技巧。
对于相对定量的实验,采用SYBR Green染料是常见的方法。内参基因一般选用18S rRNA,而目的基因则根据实验需求选择相应的序列。实验设计中,内参基因包括对照组和实验组,目的基因也是如此。实验通常设置三个平行样本,以确保数据的可靠性和准确性。
在数据处理过程中,我们首先计算每个样本内参基因和目的基因的平均Ct值。然后,计算目的基因与内参基因之间的相对表达量,即计算△Ct值。具体来说,对于每组样本,我们用目的基因的Ct值减去内参基因(如18S rRNA)的Ct值,得到△Ct值。接着,我们计算对照组与实验组之间的相对表达量差异,即△△Ct值。
在得出△△Ct值后,我们可以使用2的负△△Ct次方来表示目的基因相对于内参基因的相对表达量变化。如果2的负△△Ct次方等于1,这表明目的基因的表达量没有显著变化;如果大于1,则说明目的基因在实验处理后表达量增加;如果小于1,则表明目的基因表达量减少。
值得注意的是,如果内参基因的数据Ct值差异在1以内,可以考虑将所有内参基因的数据取平均,这样可以进一步提高数据的稳定性和可靠性。
除了使用Excel进行数据处理外,还有一些其他软件可以用于Real-time PCR数据分析,例如Bio-Rad公司的Cq软件和Quant Studio软件。这些软件提供了更便捷和直观的数据处理功能,可以帮助研究人员更加高效地解读实验结果。