南京港澳通行证的办理地点遍布全市，具体如下：
南京市公安局出入境接待大厅周一至周五：8:30-17:00；周六：9:00-17:00。南京市公安局出入境河西接待大厅周一至周五：上午9:00-12:00，下午13:30-17:30（夏季下午14:30—17:30）。鼓楼区公安分局出入境接待大厅周一至周五：8:30-17:30；周六：9:00-12:00，13:00-17:00（夏季14:00-17:00）。鼓楼区公安分局山西路受理点周一至周五：9:00-17:30。鼓楼区公安分局湖南路派出所受理点周一至周五：9:00-12:00；14:00-17:30（夏季15:00-17:30）。建邺区公安分局出入境接待大厅周一至周六：9:00-12:00,13:30-17:30（夏季14:30-17:30）。玄武区公安分局出入境接待大厅周一至周五：8:30-17:30；周六：9:00-12:00,14:00-17:00。
此外，还有多个受理点，如南京市公安局出入境河西接待大厅周一至周五：上午9:00-12:00,下午13:30-17:30(夏季下午14:30—17:30)。鼓楼区公安分局山西路受理点周一至周五：9:00-17:30。鼓楼区公安分局湖南路派出所受理点周一至周五：9:00-12:00；14:00-17:30（夏季15:00-17:30）。建邺区公安分局出入境接待大厅周一至周六：9:00-12:00,13:30-17:30（夏季14:30-17:30）。玄武区公安分局孝陵卫派出所受理点周一至周五：9:00-12:00；13:30-17:00（夏季14:00-17:00）。秦淮区公安分局出入境接待大厅周一至周五：9:00-17:00；周六：9:00-12:00,14:00-17:00。雨花台区公安分局出入境接待大厅周一至周六：9:00-12:00,13:30-17:30（夏季14:30-17:30）。雨花台区公安分局岱善派出所受理点周一至周五：9:00-11:30,14:00-17:30（夏季15:00-17:30）。栖霞区公安分局出入境接待大厅周一至周五：8:30-17:00。栖霞区公安分局仙林大学城栖霞区行政服务中心受理点周一至周五：9:00-17:30，周六：上午：9:00-12:00；14:00-17:30。
江宁区公安分局出入境接待大厅周一至周六：8:00-19:00。江宁区公安分局高新园派出所受理点周一至周五：9:00-12:00;14:00-17:30。浦口区公安分局出入境接待大厅周一至周五：9:00—12:00;14:00—18:00（夏季14:30-18:00）；周六：9:00-12:00;14:00-17:00（夏季14:30-17:00）。经济技术开发区出入境接待大厅周一至周五：9:00-11:50;14:00-17:00（夏季14:30-17:00）。江北新区公安分局出入境接待大厅周一至周五：9:00-17:30；周六：9:00-11:30,14:00-17:30。
溧水区公安分局溧水区政务中心出入境受理点周一至周五：8:30-11:30;14:00-17:30；周六：8:30-11:30;14:00-17:00。高淳区公安分局高淳区政务中心出入境受理点周一至周五：8:30-11:45;13:30-17:00；周六：8:30-11:30;13:30-16:30。六合区公安分局六合区政务中心出入境受理点周一至周五：8:30—12:00;14:00—17:30；周六：9:00-11:30;14:00-17:00。
南京市公安局出入境接待大厅24小时自助服务点全年无休（24小时服务）。鼓楼区宁海路警务站港澳台自助签注点全年无休（24小时服务）。栖霞区迈皋桥警务站港澳台自助签注点全年无休（24小时服务）。江北新区十村警务站港澳台自助签注点全年无休（24小时服务）。玄武区梅园警务站港澳台自助签注点全年无休（24小时服务）。建邺区江东警务站港澳台自助签注点全年无休（24小时服务）。建邺区奥体警务站港澳台自助签注点全年无休（24小时服务）。秦淮区瑞金路警务站港澳台自助签注点全年无休（24小时服务）。
网上预约流程如下：1.进入南京公安微信公众号-点击下方微服务-出入境-预约申请，填写相关的申请预约信息，完成可以，可以代他人预约哦。2.在预约时间段内，带齐材料前往预约受理点，按照工作人员指引办理即可。3.窗口受理后，领取受理回执单，支付缴纳费用(刷卡/微信)暂不支持现金及支付宝。
南京及省内户口办证，7个工作日取证，省外户口办证，审核没有问题，取证时间是20天(核查时间不算在内)，受理后可在南京公安微信平台上自助查询。(手机微信需要先实名认证才可以)具体操作过程如下：点击屏幕下方菜单栏里的“微服务”，页面跳出后选择“出入境服务”，出现“办证进度查询”，输入您的业务受理编号即可查询。
