在治疗气管炎的过程中，控制感染是首要步骤。根据感染的主要致病菌和感染的严重程度或根据病原菌药敏结果，选择合适的抗生素。轻度感染可口服青霉素G、红霉素等，中重度感染则可能需要肌注或静脉滴注，如氨基甙类、喹诺酮类、头孢菌素类抗生素。窄谱抗生素应优先考虑，避免使用广谱抗生素，以防二重感染或产生耐药菌。
对于急性发作期的患者，在抗感染治疗的同时，应配合祛痰、镇咳药物，以缓解症状。尤其是迁延期病人，应坚持用药，以期达到消除症状的效果。常用的祛痰药物包括氯化铵合剂、溴已新、维静宁等。中成药止咳也有一定效果。对于老年体弱或无力咳痰的患者，应以祛痰为主，协助排痰，确保呼吸道畅通。应避免使用强的镇咳剂，如可待因等，以免抑制中枢神经，加重呼吸道阻塞和炎症，导致病情恶化。
解痉、平喘也是治疗气管炎的重要环节。常用的气道舒张剂包括氨茶碱、特布他林（terbutaline）等口服药物，以及沙丁胺醇等吸入剂。如果气道舒张剂使用后仍有持续阻塞，可考虑使用皮质激素，如泼尼松20－40mg/d。
气雾疗法是一种有效的辅助治疗手段。通过气雾湿化吸入或加入复方安息香酊，可稀释气管内的分泌物，促进排痰。对于痰液粘稠不易咳出的患者，超声雾化吸入是一种可行的方法。在雾化液中加入抗生素及痰液稀释剂，可进一步促进痰液排出。
