9月15日起，全国公安机关出入境管理部门将启用电子往来港澳通行证，旧版本式往来港澳通行证将停止受理申请。新版通行证不仅大小与身份证相当，还内嵌非接触式集成电路芯片，存储持证人个人信息及证件、签注签发管理信息。采用成熟的数字安全防伪机制，并使用多项物理防伪技术，显著提升了防伪性能。
新证签注不再采用贴纸方式，而是直接打印在证件背面，可反复擦写。新版通行证有效期分为5年和10年，申请人年满16周岁者签发10年有效通行证，未满16周岁者签发5年有效通行证。申请新版通行证需留存指纹信息，并按要求填写《中国公民出入境证件申请表》和提交相关证明材料。16周岁以上申请人必须采集指纹，16周岁以下申请人是否采集指纹根据监护人意见确定。
新版通行证的便利之处在于，证件内存有数字化的个人资料和指纹信息，可由系统自动查验比对，符合条件的持证人可以自助通关，包括免登记使用港澳地区口岸的自助查验通道，提升通关效率。此外，新版通行证采用PET类环保材料通过高温层压制作而成，内含精密电子元件，持证人应避免证件弯折、刮擦、水浸或接触高热、强光、强磁场等环境。
申请新版通行证时，需注意如持证人希望免登记使用港澳地区自助查验通道通关，还应在申请电子往来港澳通行证时签署《免登记使用港澳地区自助查验通道声明》（不满16周岁的由其监护人签署）。一般情况下，需采集右手、左手指纹各1枚。新版通行证启用后，仍在有效期内的现行往来港澳通行证及往来港澳签注可以继续使用。
