《理科生坠入情网故尝试证明》第二季评分低原因如下：
1、剧情逻辑架构问题。男女主的恋情证明在第二季中显得过于拖沓，明明两人已经明白相爱是个人化的事情，没有普遍的定理，但剧情仍然硬要把恋爱证明进行下去，使得剧情失去了从前的轻松愉悦感。
2、作品主旨的改变。随着主线剧情的进行，作者开始尝试探寻更多的发展方向，这样的尝试让作品越来越不像恋爱喜剧，尤其是在奏的支线中，有大量的关于青春期烦恼的描写，画风渐渐转向阴郁，这无疑劝退了许多观众。
3、观众期待值落差大。理科生的出彩点在于其独特的模式，即用一种夸张式的理科思维来解析恋爱。然而，当第二季给出答案时，观众的期待值落差较大，认为作者没有给出令人满意的答案，而是强行给了个废话，导致观众感到失望。
4、角色设定和人物关系处理不当。第二季中加入了新角色，但处理得不够圆满，使得新角色线显得单薄。同时，对于奏对雪村的感情处理也显得过于突兀，没有必要塑造成爱情，这可能导致部分观众对人物关系感到混乱和不满。
5、人物形象的崩坏。作为一个虚构的文艺作品，角色由于阅历、年龄、具体处境的变化而变化是正常的，然而，在第二季中，一些人物形象的变化可能没有得到观众的认可，导致观众对人物形象感到失望。
