如下：
1、2.7亿年前的二叠纪，石林地区为海洋环境，海底沉积形成了厚层石灰岩。这是石林形成的物质基础。
2、2.6亿年前，地壳运动使石林地区抬升成为陆地，石灰岩受到挤压，产生破裂。抬升成为陆地的同时，石灰岩中发育了最早期的石林。
3、2.5亿年前大规模的火山喷发，将早期的石林覆盖于火山岩（玄武岩）之下。经过近2亿年的覆盖，约6500万年前，火山岩大部分被剥蚀，早期石林再次露出地表。
4、5000万年至2000万年前，地壳抬升使石林地区大部分成为湖泊，部分石林再次被湖泊沉积物覆盖。
5、2000万年来，古湖消失，石林地区逐渐向高原盆地演化，同时发育了最新一期的石林。
