中药神曲，又称为六神曲，其制作方法独特，始于《药性论》。其主要原料包括面粉或麸皮，以及杏仁泥、赤小豆粉等，混合后发酵而成。全国各地皆有生产。神曲的制备过程较为复杂，首先将面粉或麸皮与杏仁泥、赤小豆粉混合，再加入鲜青蒿、鲜苍耳、鲜辣蓼的自然汁，搅拌均匀后，制成小块，放入筐内，覆盖麻叶或楮叶，保温发酵一周。待长出黄菌丝后取出，切块晒干即成。
神曲有生用和炒用两种方法。其药材性状为方形或长方形块状，约3厘米宽，1厘米厚，外表土黄色，粗糙，质地硬脆，易断，断面不平，类白色，可见被粉碎的褐色残渣及发酵后的空洞。有陈腐气。神曲的主要成分包括酵母菌、酶类、维生素B复合体、麦角固醇、挥发油、苷类等。
神曲具有促进消化、增进食欲的作用。其性味归经为甘、辛，温，归脾、胃经。功效主要表现为消食和胃，适用于饮食积滞，脘腹胀满，食少纳呆等症状。
建曲是神曲的一种变种，主要原料包括麦粉、麸皮、紫苏、荆芥、防风、厚朴、白术、木香、枳实、青皮等数十种药物，经发酵专制而成，主产于福建省泉州。建曲性味苦微温，与神曲相似，但更擅长理气化湿、健脾和中，还适用于暑湿泄泻、呕吐不食等症状，用法用量与神曲相同。
广东神曲则是一种中成药，由多种药材组成，包括前胡、甘草、大黄、使君子、高良姜、百合、苍术、栀子、莪术、薄荷、防风、羌活、姜黄、陈皮、山楂、蒲黄、柴胡、麦芽、厚朴、白扁豆、紫苏叶、苦杏仁、葛根、车前草、槟榔、泽兰、薏苡仁、独活、荆芥、木香、麻黄、益母草、青皮、乌药、桔梗、诃子等。具有祛风消滞，健胃和中的功效，适用于感冒发热、食滞、呕吐、泄泻等症状。
