关于三本院校是否全部升级为二本的问题，答案是否定的。虽然部分三本院校确实进行了升级，但大多数院校的性质并未改变，依旧保持为民办学院。这意味着即便有些院校在办学水平、教学质量上有所提升，它们的学校性质依然没有变化。
对于学费的问题，值得注意的是，即使有部分三本院校升级为二本，其学费标准依然可能保持不变甚至有所上涨。这是因为，一些升级后的院校依旧为民办性质，而民办院校的学费通常高于公办院校，尤其是那些提升后的二本院校。
相比之下，公办二本院校的学费标准相对较低，这主要因为它们由财政支持，学费收入用于改善学校设施、提高教师待遇、引进优质教育资源等方面。因此，对于学生及家长而言，在选择院校时，除了关注其教学质量与学术氛围外，还应考虑学费负担。
综上所述，三本院校升级为二本并不意味着学费会随之降低。因此，在选择院校时，应综合考虑学校的性质、学费标准、教学质量等多方面因素，以确保选择最适合自己的教育机构。
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