车辆电子眼违章在年审时是否会被扣分，主要取决于违法行为的性质及其对应的扣分标准。通常，违法内容被分为几个等级，每个等级的扣分标准不同。
首先，对于一次记12分的违法行为，包括但不限于驾驶与准驾车型不符的机动车，酒驾，超载比例超过20%，以及造成交通事故后逃逸等严重违规行为。
其次，对于一次记6分的违法行为，如驾驶证暂扣期间驾驶机动车，超速20%但未达50%，或者违反禁令标志和禁止线指示等。
再者，一次记3分的违法行为包括超载但未达30%，在高速公路上行驶低于规定最低时速，违反规定牵引挂车等。
对于一次记2分的违法行为，如在交叉路口不按规定行车或停车，驾驶二轮摩托车未戴安全头盔等。
最后，一次记1分的违法行为，包括不按规定使用灯光，驾驶机动车不按规定会车等轻微违规行为。
在年审时，如果驾驶者的电子眼违章累计记分达到一定标准，将可能面临扣分处理。具体扣分情况会根据违章行为的性质和严重程度决定。
因此，驾驶者应当重视日常驾驶中的安全与规范，以避免不必要的违章行为和可能产生的扣分后果。同时，定期检查车辆状况和及时处理违章记录也是保持良好驾照记录的重要措施。
