连锁经营的组织结构主要包括总部、配送中心和连锁分店三个部分。对于规模较小的连锁企业，可能只需要总部和分店。连锁总部承担着关键职能，如决策、指令与监控，财务管理，制度管理，信息收集、分析、整理与研究，以及重大经营、投资、开发、营销、发展问题的决策。
总部管理模式通常适用于初创时期或特定市场环境下的连锁企业，总部直接管理门店。总部设置有总经理室、营业本部和管理本部，总经理负责管理开发部、营运部、商品部、财务部、管理部和企划部等职能部门。
地区管理部管理模式则适用于连锁企业已经具有一定规模，门店数量多且分布广泛的情形。总部会根据地区设立多个地区管理部，由地区管理部负责管理门店，总部不再直接管理门店。
配送中心是连锁企业物流网络中的重要组成部分，它专门从事货物配送活动，位于物流节点上，作为连锁企业的物流机构。设立配送中心的前提条件包括连锁企业分店数量和商品经营规模达到一定水平，以及在一定经济区域内分店数量达到一定规模。
配送中心的业务包括接收总部决定的由供货商送来的商品并进行验收与入库，管理库存商品，以及对各连锁分店所需商品进行加工、整理、包装、集配和送货。这些业务确保了连锁企业运营的高效与顺畅。详情
