慢性萎缩性胃炎的治疗方式多样，结合中医辨证治疗与西医治疗最为理想。中医治疗通过改善胃黏膜状态而展现其独特疗效，而西医在根除幽门螺旋杆菌方面的利弊则尚未定论，因此中西医结合治疗效果显著。
治疗过程较为复杂，至少需要三个月才能看到一定的改善效果，患者不应过于急躁。保持良好情绪和适当锻炼是康复的关键，心理状态对疾病的恢复有着重要的影响。
平时应避免食用辛辣刺激性食品，如浓茶、咖啡、辣椒、羊肉、狗肉等，以及油炸、过于油腻、烧烤、烟熏等食品。这些食物可能导致胃酸分泌异常，损伤胃黏膜。戒烟戒酒也是治疗过程中不可忽视的重要措施。
除了药物治疗，还可以通过食疗辅助治疗萎缩性胃炎。例如，姜枣猪肚汤，将猪肚150克、生姜15克、大枣20克隔水炖熟后分两次食用，此汤适用于治疗胃阳虚导致的吐清水等症状。
参须石斛滋胃汤，将人参须10～15克、石斛12～15克、玉竹12克、淮山药12克、乌梅3枚、大枣6枚水煎后分两次服用。此汤适用于治疗萎缩性胃炎气阴不足引起的纳少、胃脘不适及食欲不振等症状。
