毓婷作为紧急避孕药，其常见副反应主要包括头晕、恶心和乏力，这些症状的发生率大约在5%到10%之间，并且通常程度轻微。这些副作用大多在服药后的第一天内出现，并且多数情况下不需要特殊治疗，因此使用者无需过分担忧。
值得注意的是，如果在饭后服药，可以在一定程度上减轻甚至避免上述的副反应。尽管如此，仍有大约不到2%的妇女在服用紧急避孕药后可能会发生呕吐。如果呕吐发生在服药后的2小时之内，那么需要补服一片药物，而第二次服药的时间则保持不变。
毓婷提供了两种包装规格，一种是包含2片的包装，另一种则是包含4片的包装。其中，4片装的包装是考虑到万一出现呕吐需要补服的情况而设计的备用剂量。对于大多数没有发生呕吐的妇女而言，4片的包装也可以作为第二次紧急避孕时的用药选择。
由于紧急避孕药的作用机制包括抑制和延迟排卵以及抑制子宫内膜的生长，它可能会导致使用者的下次月经延期。此外，由于药物引起的血液中激素水平暂时升高和随后的下降，部分使用者可能会出现撤退性出血，表现为月经提前。据统计，大约有70%的妇女在服用紧急避孕药后月经会如期来潮，与其预期日期相差不超过3天。而月经提前的发生率（根据服用的紧急避孕药种类不同而有所差异）一般在10%到15%之间，有的人可能会提前7到10天。
如果月经出现延期，首先应当排除妊娠的可能性。如果已经超过下次月经日期一周，建议进行尿妊娠试验以确认是否怀孕；如果两周后月经仍未来潮，应由医生决定是否需要进行诱导月经的治疗。
尽管紧急避孕药的剂量较小、在体内的存留时间较短、使用相对安全，但它仍然会对排卵和子宫内膜产生影响。短期内反复使用可能会增加月经紊乱的风险。此外，与常规避孕药相比，紧急避孕药的效果相对较差，其避孕有效率仅为80%，而复方短效口服避孕药的效果可达99%以上。因此，紧急避孕药应仅作为事后的临时补救措施，而不应作为常规的避孕手段。
