遗传因素、营养状况、睡眠质量以及运动习惯等都可能影响孩子的生长发育。对于一个三岁男孩身高矮小的情况，以下是一些建议：
1. **专业评估**：首先，应该带孩子去看医生，进行专业的生长评估。医生可能会建议做一些血液检查来评估生长激素的水平，以及其他可能影响生长的健康状况。
2. **均衡饮食**：确保孩子的饮食中含有充足的营养素，特别是蛋白质、钙、锌和维生素D，这些都是对骨骼生长至关重要的。如有必要，可以咨询营养师以制定更适合孩子的饮食计划。
3. **适量运动**：鼓励孩子参与适量的运动，如游泳、跑步和跳跃游戏，这些活动有助于刺激骨骼生长。
4. **充足睡眠**：保证孩子有充足的睡眠时间和良好的睡眠质量。睡眠是身体恢复和生长的重要时期。
5. **医疗干预**：如果经过评估发现孩子确实存在生长问题，医生可能会建议使用生长激素治疗。但这种治疗需要在医生的指导下进行，并且需要家长长期配合。
6. **心理支持**：家长应该避免给孩子过大的压力，要给予他们足够的关爱和支持，帮助他们建立自信。
总之，对于三岁男孩身高矮小的问题，家长应该采取积极的措施，同时保持耐心和理解，与专业医疗人员合作，以确保孩子能够健康成长。
