在亲子关系认定中，如果非婚生子女的生父否认亲子关系，而双方又未能达成共识，应如何处理呢？首先，确认孩子的生父是关键，一旦确认，可以向法院提起诉讼，请求法院要求对方进行亲子鉴定。法院会依法通知对方参与鉴定，这是为了确保亲子关系的公正认定。
如果对方拒绝进行亲子鉴定，法院将依据现有证据和事实，进行推定，认定孩子与对方存在亲子关系。这样的推定结果，将使对方承担相应的法律义务，包括但不限于抚养、教育和保护孩子的权利与责任。
值得注意的是，亲子鉴定并非唯一手段。在某些情况下，可以通过收集其他相关证据，如医疗记录、出生证明、证人证言等，来证明亲子关系。这些证据同样具有法律效力，能够作为法院判决的重要依据。
此外，亲子鉴定虽然可以明确亲子关系，但其结果也可能带来家庭矛盾和心理压力。因此，在采取法律手段之前，建议先尝试通过沟通和协商解决争议，尽量避免不必要的纠纷。
总之，面对非婚生子女的亲子关系认定问题，应当通过合法途径寻求解决，确保孩子的合法权益得到保护。同时，也要考虑到家庭和谐的重要性，尽可能采取更为温和的方法，避免激化矛盾。
