目前临床上常用的治疗幽门螺杆菌感染的药物包括胶体铋盐、痢特灵、灭滴灵等。胶体铋盐具有抗酸、收敛、保护胃粘膜及增加胃粘液分泌的作用，对幽门螺杆菌有很强的杀伤力。常用的三钾二构椽酸络合钻（商品名又叫迪乐或得乐冲剂），每次1包，每日4次，疗程为4周，可连续服用2个疗程。尽管铋盐能加强胃粘膜防御，遏制幽门螺杆菌，但长期服用会引发便秘、头昏、嗜睡、咽痛等副作用，一般不应超过8周。
痢特灵（映喃唑酮）能够有效杀灭幽门螺杆菌，但可能引起恶心、上腹不适和便秘等副作用。灭滴灵（甲硝唑）对幽门螺杆菌有一定的清除作用，但由于易产生耐药性，临床上应用较少。庆大霉素口服对幽门螺杆菌有一定的杀灭作用，但由于疗效不明确，目前临床上应用不多。
近年来，临床上开始尝试使用两种药物联合治疗幽门螺杆菌，这种治疗方式比单一用药的清除率更高，耐药性更低。可采用胶体铋与抗生素（如氨苄青霉素、灭滴灵等）联用；或羟氨节青霉素与另一种抗生素（如灭滴灵、痢特灵等）联用。
近两年，研究提出了三种药物联合治疗的方案，具体包括：胶体锁（胶体铋120毫克，每日4次）、经氨节青霉素（400毫克，每日3次）和灭滴灵（500毫克，每天4次）；痢特灵、羟氨节青霉素和灭滴灵合用；痢特灵、灭滴灵和庆大霉素（或土霉素）合用。尽管三种药物联合治疗可显著提高幽门螺杆菌的清除率，但因其副作用较大，应谨慎考虑使用。详情
