沪昆专线长沙至昆明段的建设引起了曲靖市相关部门的高度重视。曲靖市与铁路规划设计部门积极配合，共同推进项目的进展。为了确定线路的具体走向和站位设置，相关部门进行了多次实地踏勘，并组织了多场讨论会。在富源县和马龙县的站点设置上，各方意见趋于一致，但对于线路通过曲靖城区的具体方案，仍存在争议。
中铁二院提出了中线、南线和北线三个方案。经过讨论，中线方案因涉及搬迁企业多、拆迁面积大等问题被放弃。最终，会议倾向于南线方案。该方案从富源北站引出，经过多乐，上跨盘西铁路和曲胜高速公路，设隧道穿越曹家大山，进入曲靖坝子，沿坝子边缘行走，经大龙、鸡街，在新发村设曲靖南站。出站后线路转向西，进入昆明。
南线方案的优势在于符合省政府批准的珠江源大城市发展规划，对曲靖未来城市经济发展有积极影响，且对珠江源大城市未来发展的影响较小。此外，该方案还有利于加快曲靖城区组团建设住房的步伐，保护曲靖居民饮用水源地，避免重复建设，减少与主干公路和河流的交叉，减少沿线企事业单位的拆迁。南线方案的主要弊端是线路比北线方案长2.89公里，拆迁面积更大，且通过软土基的长度也比北线方案长。
相比之下，北线方案线路比南线方案短2.89公里，工程投资相对较少，地质条件也优于南线方案。车站设置在城市建成区附近，靠近沾益县，有利于旅客乘车，且拆迁面积相对较小。然而，北线方案的车站位置靠近城市北角，交通组织较差，与主干公路和铁路交汇较多，对沿线工矿企业也有较大的干扰。
