如果在网上购票后退票，票款通常会退回到购票时所用的银行卡中。通过网银操作的退款一般在几分钟内就能到账，而使用信用卡退票则可能需要等待两到三天。因此，建议在退票或改签时保存好相关凭单，并记录好购票日期、退票/改签日期、车次及金额等信息。
如果遇到退款未到账的情况，可以前往当时退票的火车站反映情况，工作人员会将情况反馈给铁道部清算中心进行处理。此外，也可以选择拨打12306客服电话，说明具体问题，等待处理结果。同时，还可以将退票信息发送至kyfw@12306.cn邮箱，等待官方处理。
中国铁路客户服务中心（12306网）作为铁路服务客户的重要窗口，集成了全路客货运输信息，为社会和铁路客户提供客货运输业务和公共信息查询服务。客户可以通过登录该网站查询旅客列车时刻表、票价、列车正晚点、车票余票、售票代售点、货物运价、车辆技术参数以及有关客货运规章等信息。此外，铁路货运大客户还可以通过该网站办理业务。
从2014年12月1日起，铁路互联网售票预售期逐步延长至60天。2015年3月，12306的动态验证码改为随机图片。2015年12月1日起，铁路客票系统开始启用网上购票“选座功能”。2017年10月12日，12306网站C、D、G字头的动车组列车选座功能正式上线运行。
