证书颁发单位不同、等级划分不同、认可度和含金量不同、性质不同。
1、证书颁发单位不同：电工技能等级证书是由人社部组织考试和颁发的证书；电工操作证是由国家安监局组织考试和颁发证书。
2、等级划分不同：电工操作证有高压电工证、低压电工证、防爆电工证等；电工技能等级：分为五个等级：初级、中级、高级、技师、高级技师。
3、认可度和含金量不同：电工操作证在行业中对于电工操作证认可度高，毕竟电工操作证是特种工上岗操作证是从事电工行业所必须拥有的证书，没有这个证书是不允许从事电力相关行业的；技能等级证书在行业中应用范围窄，只针对一些特殊岗位才需要具有这个证书，考生想要评职称或者晋升管理层或者公积分、申请公寓等才会需要技能等级证书。
4、性质不同：电工操作证在行业中只要是想要从事电气维修或者安装等相关工作内容就必须持有，没有是不允许从事相关岗位工作；技能等级证书主要是为自己以后的发展需求进行考取的证书，尤其是在晋升管理层来讲才需要，毕竟高级电工以后岗位从事需要具备一定的管理能力。
