核磁共振是可以进行医保报销的，要记住申请报销的程序和环节，平时要多注意了解医保政策，只有审核通过的人才可以进行报销。核磁共振是当下最常见的，对机体进行检测的方式，它通过改变体内的磁场线，观测出体内器官是否出现了异变情况，以及疾病是否产生。因为不一样的位置产生的黑白程度不同，将每一个组织区别开来，从而利于机体的检查。
核磁共振的医保报销流程要牢记，参与报销的患者在出院后，将签过字的住院的发票和费用清单以及其他必要的证明，一并递交给合管所，只有经过严格审查后才可以上交，并确认同意报销。
新农合一般是不会报销磁共振检查的，一般只能够报销住院产生的费用，单纯的检查费用是不在报销范围之内的。通过磁共振检查，能够观察到局部的结构与分布，对于局部是否存在器质性病变，可以作为诊断依据。在检查期间有一些注意事项，要避免携带金属器具或者电子产品，会干扰到正常检查结果。
住院的核磁共振检查能报销，但是通常只能够报销一部分。具体报销比例与患者所交的医保类型有一定的关系，比如农村合作医疗的报销比例通常会稍微低一点，而城镇职工医保报销的比例可能会稍微高一点。
比较好的单位医疗保险可能会报销90%左右，还有的患者有可能交商业保险也能报销一部分。对于具体报销的比例，患者可以咨询医保科，会给予具体的答案。如果是商业保险，患者要咨询保险公司，看患者交的哪种商业保险，是一次性付清还是按照比例给付新农合医保报销标准为20%到60%，根据患者住院治疗情况，不同等级医院报销比例不同。现在大部分农村居民都参加新农合，自己选择一个缴费档次，患病后在定点医院治疗，可以报销一部分费用。可以分为门诊报销和大病医保报销。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》 第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
