疫情隔离期间的费用由谁承担要视情况而定，具体如下：
1、对于罹患新冠肺炎的病人，进行隔离期间治疗病情所花费的费用目前由国家进行承担，病人一般不需要花费治疗费用。根据我国所发布的相应通知，确保患者不因费用问题影响就医。
2、实施集中隔离或居家隔离措施中所产生的住宿费和餐费等相关费用由个人支付；
3、对集中隔离人员隔离期间发生的住宿费和餐费，由实施隔离地按照不高于去年同期费用标准的原则，制定具体收费标准。对确有困难的人员，由各市确认后视情给予适当补助，具体如下：
（1）对于确诊新型病毒感染的肺炎患者发生的医疗费用，在基本医保、大病保险、医疗救助等按规定支付后，个人负担部分由财政给予补助，实施综合保障。
（2）对于确诊新型病毒感染的肺炎的异地就医患者，先救治后结算，报销不执行异地转外就医支付比例调减规定。
（3）确诊新型病毒感染的肺炎患者使用的药品和医疗服务项目，符合卫生健康部门制定的新型病毒感染的肺炎诊疗方案的，可临时性纳入医保基金支付范围。
（4）对于卫生健康部门新型病毒感染的肺炎诊疗方案确定的疑似患者医疗费用，在基本医保、大病保险、医疗救助等按规定支付后，个人负担部分由就医地制定财政补助并安排资金，实施综合保障，财政视情给予适当补助。
法律依据
《中华人民共和国传染病防治法》
第四十一条在隔离期间，实施隔离措施的应当对被隔离人员提供生活保障。地方各级应当保障城市社区、农村基层传染病预防工作的经费。
《关于做好新型冠状病毒感染的肺炎疫情医疗保障的通知》
第二条确保患者不因费用问题影响就医。一是对于确诊新型冠状病毒感染的肺炎患者发生的医疗费用，在基本医保、大病保险、医疗救助等按规定支付后，个人负担部分由财政给予补助，实施综合保障。二是对于确诊新型冠状病毒感染的肺炎的异地就医患者，先救治后结算，报销不执行异地转外就医支付比例调减规定。三是确诊新型冠状病毒感染的肺炎患者使用的药品和医疗服务项目，符合卫生健康部门制定的新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案的，可临时性纳入医保基金支付范围。
《中华人民共和国传染病防治法》
第四十一条 对已经发生甲类传染病病例的场所或者该场所内的特定区域的人员，所在地的县级以上地方可以实施隔离措施，并同时向上一级报告;接到报告的上级应当即时作出是否批准的决定。上级作出不予批准决定的，实施隔离措施的应当立即解除隔离措施。
在隔离期间，实施隔离措施的应当对被隔离人员提供生活保障;被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。
隔离措施的解除，由原决定机关决定并宣布。
