一、农村合作医疗跨市报销比例
1、市级定点医院就医，起付线为500元，那么报销比例为65%，详细内容如下：
乡镇卫生院就医，起付线为100元，报销比例为90%;
县级定点医院就医，起付线为200元，报销比例为82%;
省级定点医院就医，起付线为700元，报销比例为55%;
省外非定点医院就医，起付线为1000元，报销比例为45%。异地就医时急诊、门诊和住院产生的费用，若在当地新农合的报销范围内，都可以申请报销，报销人只需要携带相关材料前往社保局申请即可
2、异地就医的，住院才能报销，门诊的不能报。
二、异地就医报销流程为：
1、患者本人/家属带患者身份证(或户口本)、两张一寸彩色照片、新农合医疗证到参合地经办机构转诊备案手续，也可以致电办理;
2、携带患者身份证、新农合医疗证和转诊备案手续到转诊医院就医，办理新农合住院手续，只能找跨省定点医疗机构就医;
3、患者住院接受治疗;
4、出院后，凭患者本人身份证(或户口本)、新农合医疗证、病历复印件、住院结算单(有的是发票形式的)、住院费用清单、转诊备案手续到参合地经办机构报销
法律依据《中华人民共和国社会保险法》第三十条，下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围:
（一）应当从工伤保险基金中支付的；
（二）应当由第三人负担的；
（三）应当由公共卫生负担的；
（四）在境外就医的。
医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。
